入室許可の表と入退室ログの表の関連がない理由は
入室管理システムとは別に他のアプリケーションで処理するからでしょうか？

関連があるとしたら、「入室許可」側が１、「入退室ログ」側が多のリレーションになると思います。
したがって、「入退室ログ」側に、「入室許可」の主キーである3個の項目を外部キーとして持たせます。
が、「入退室ログ」に持たせるべき外部キーの一つ、「入室許可開始年月日」はありません。

よって、リレーションは存在しません。

ご回答ありがとうございます。
入室許可の表の主キーは社員ID、室IDの他に、入室許可開始年月日も含まれるんですね。
見直したら、よく分かりました。