https://www.ap-siken.com/kakomon/23_toku/pm07.html

設問１の解答が理解できません。
間違えた、というわけでなく、答えの導き方が全くわかりません。
どなたかお願いいたします。

図４より対応するPIO_Dがどのように使われているかで考えていきます。
D13からD0はLEDにつながっています、図１「PIO→LED（６個）」により出力となります。
D14はSWにつながっています、図１「SW→PIO」により入力となります。
D15は未使用です、設問中の「ただし，PIO_Dの未使用のビットは入力として設定すること。」により入力となります。

PIO_Rは入力が0、出力が1であり、
R15からR0は 0011 1111 1111 1111 となります。
これを16進数に直して 3FFF となります。