https://www.ap-siken.com/kakomon/25_aki/pm03.html

設問4の（2）が分かりません。
新構成では片方の物理サーバーに全部寄せられるのに、なぜ再起動で停止や縮退運用が必要なのでしょうか？
空になった方のサーバを再起動すればいいのではないでしょうか？

設問4(1)は，下線①（物理サーバの）ハードウェア点検についての問いで，
設問4(2)は，下線②（仮想サーバの）セキュリティパッチについての問いです。

> また，セキュリティパッチについては，
> 情報システムを構成するOSやミドルウェアにセキュリティパッチを適用する。
> セキュリティパッチの種類によっては，サーバの再起動が必要になる。

という問題文より，

> 設問4(2) サーバの再起動が必要なセキュリティパッチを適用する場合，

という設問文の「サーバ」とは，物理サーバA/B ではなく
ソフトウェアのサーバ，仮想サーバであることが分かります。

それに対して，質問者の次の発言における

> 新構成では片方の物理サーバーに全部寄せられるのに（略）
> 空になった方のサーバを再起動すればいいのではないでしょうか？

「空になった方のサーバ」は物理サーバを指しています。
（空の仮想サーバというものは登場しないので）